在《穿越吧英雄》中进行英雄位置安排时，要考虑其英雄的体实力和所在战队中的位置。在游戏前期手中武将数量不多时，可以根据系统中介绍的英雄实力水平进行搭配。英雄上阵的顺序是史诗级、传奇级和普通级。

玩家在《穿越吧英雄》的中期已经能够获得足够的英雄了，这个时候你就可以好好的搭配英雄的奇缘了。此时很好的选择将同一阵营史诗英雄的奇缘激活，然后让这些英雄上阵就能获得最大的加成。同时在空阵位中安排可以激活奇缘的英雄。

但最好的选择还是上阵多个阵营的史诗英雄。这样会让奇缘加成和武将的基础加成水平高出不少。但是这种选择会让英雄培养难度升高。玩家还可以自己探索更多合适的方案和最适合自己的英雄搭配。

在进行闯荡任务时也非常考验玩家的阵容搭配， 如果搭配的好能让自己的英雄和装备获得更快的升级。因此如何运用有限的资源获得更高战力就成了一个大问题。

在《穿越吧英雄》的闯荡任务中基本都是一些控制能力比较弱的NPC。虽然碰到高战力NPC时玩家的攻防能力较弱，但是如果充分发挥必杀的作用来削弱NPC的输出就能获胜。

例如能附加怒气、眩晕和封印的必杀技就能让玩家掌握战场节奏，从而让玩家逆袭高战力NPC成为可能。因此多培养一些这样的英雄对快速推图是十分有帮助的。