公会副本是公会玩法中最重要的组成部分，和一般副本不同的是吗，玩家可以与公会的成员们一起通过合作完成挑战。开启公会副本是需要条件的，只有在当前公会贡献值满足开启需求的情况下才能进行，而且一个公会副本当天是只能开启一次的。也就是说如果在公会副本开启的时候你没能参加，那么当天的副本挑战你就没有机会再参与了。

作为公会会长的那一位玩家将拥有重置公会副本的权力，但是这同样需要消耗公会贡献值。每个公会内的玩家每天只能在一个副本进行2次挑战，且每一次只能完成1个关卡。当前的挑战时间限制为2分钟，当副本的挑战进行到一定阶段时，成员们就可以进入带有BOSS的关卡挑战。另外由于凌晨3-8点为敌人休息期，所以这段时间是不允许开展公会副本挑战的。普通关卡挑战之后，全体公会成员都可以得到奖励，而完成带BOSS的关卡击杀之后，成员们还将收获到较为珍贵的物品。

公会副本的开启时间可以通过商量决定，不过不管是在哪一个时间段开启，肯定是不能满足所有玩家同时在线的需求的。会长和成员们进行商议，挑选一个多数人在线的时间，这样的话也可以有更多高手来共同击杀。由于每个成员所能够参与的次数有限制，大家也可以商议好进行轮流挑战。副本挑战完成之后，系统也会根据当前挑战者的单次输出伤害值，来发放关于贡献值的奖励。